Vue de l'extérieur, l'Organisation est une oasis de modernité dans la petite ville de Shisaido. Le grand building ferait presque tâche dans le centre-ville assez modeste, mais les silhouettes des bâtiments du quartier de Shinraku sont là pour rééquilibrer l'aspect général de l'ensemble. La construction d'un tel monument a beaucoup étonné les habitants, mais la couverture de compagnie d'assurances et d'affaires de l'Organisation a dissipé la surprise et les soupçons de la grande majorité des citoyens.

La majorité de l'immeuble de l'Organisation est composée d'open spaces, de grandes salles remplies de bureaux collés les uns aux autres. Le bureau de Dissimulation en est le principal occupant, et même si la proximité constante avec ses collègues peut paraître étouffante, cela permet aussi aux employés de discuter pendant le travail et d'échanger quelques plaisanteries ou ragots dans le dos d'Irina.

Se rendre dans les sous-sols de l'Organisation donne l'impression d'atterrir dans un film de science-fiction simplement en prenant l'ascenseur. Cet endroit du bâtiment caché aux yeux des personnes normales est celui dont la technologie est la plus avancée et comporte ainsi les bureaux et quartiers confidentiels les plus sensibles. Le bureau de Recherche et Développement s'y trouve et en occupe la majeure partie.

La cafétéria de l'Organisation est spacieuse et moderne. Comme le reste du bâtiment, ses murs extérieurs entièrement vitrés offrent une vue imprenable sur Shisaido et confèrent au lieu une atmosphère agréable et lumineuse. Les employés étant disciplinés, la cafétéria est toujours ordonnée mais un brouhaha constant y règne à l'heure du déjeuner. La plupart des employés apportent leur repas, mais une petite cuisine permet de préparer sur place des plats rapides et des distributeurs disposés de ça de là sont là pour remédier aux fringales.

L'Organisation dispose d'une terrasse en hauteur, possédant des tables, des fauteuils, des bancs et des distributeurs. C'est un lieu très apprécié des employés qui viennent y prendre une pause ou déjeuner lorsque le temps est au beau fixe. La terrasse donne sur la rivière Shizukawa et offre une magnifique vue sur le soleil couchant lorsque la journée se termine.

L'Organisation dispose de plusieurs suites assez luxueuses pour les employés n'ayant pas ou pas encore de logement en ville, ou pour ceux qui travaillent jusqu'à très tard dans la nuit. Ces suites sont composées de chambres et de salles de bains, et bien qu'elles soient chics, elles ne disposent que du strict minimum. Après tout, il s'agit d'une entreprise, pas d'un hôtel !

Le toit de l'Organisation est vaste et, contrairement à celui de l'Académie, aménagé. Il contient des bancs, des plantes vertes et un préau permettant aux employés de prendre une pause cigarette par n'importe quel temps tout en profitant de l'incroyable vue que l'immeuble offre sur Shisaido et l'océan. On peut également y trouver une piste d'atterrissage pour hélicoptère, moyen de transport de prédilection des employés en mission ainsi que d'Irina, lorsqu'elle est d'humeur à soigner ses entrées.